Het Comité voert op eigen initiatief of op vraag van de Kamer van volksvertegenwoordigers, de bevoegde minister of de bevoegde overheid toezichtsonderzoeken uit. Het Comité kan ook een onderzoek instellen na een klacht of aangifte van een burger of ambtenaar.

Na elk toezichtonderzoek wordt een rapport opgesteld met conclusies over de richtlijnen, werkzaamheden of methoden van de gecontroleerde diensten die de rechten en vrijheden van burgers in het gedrang kunnen brengen, of die wijzen op een gebrek aan coördinatie en doelmatigheid. In het verslag worden ook aanbevelingen gedaan om de vastgestelde tekortkomingen te ondervangen.

Nadat het zijn toezichtsrapport heeft voorgelegd aan de parlementaire Begeleidingscommissie en aan de bevoegde minister(s), kan het Comité beslissen om het verslag volledig of gedeeltelijk openbaar te maken.